O acervo tridimensional do MEB é composto por aproximadamente 2.000 itens entre brinquedos, jogos e materiais educativos, atualmente organizados em 91 caixas, estantes e armários, localizados em duas reservas técnicas, nas dependências da Faculdade de Educação da USP.

Possui também documentos fotográficos, textuais e audiovisuais, tendo objetos e documentos desde o início do século XX até os dias atuais.

Grande parte da sua constituição foi através de doações de alunos e professores da FEUSP bem como do público frequentador, estabelecendo assim uma característica diferenciada no processo de aquisição, guardando não apenas o objeto em si mas recuperando a memória de seu uso, por meio entrevistas orais e escritas.